HIV virusunun bilinen iki tipi vardır: HIV-1 ve HIV-2. Şimal Amerika ve Avropada meşhur olan tip ümumiyyetle HIV olaraq adlandırılarken Qerbi Afrikada seropozitif asemptomatik ferdlerden tecrid edilen yeni subtipe HIV-2 adı verilmişdir. HIV-1 ve HIV-2 suşlarının bir çox bioloji xarakterlerinin benzer olmasına qarşı bezi ferqliliklerin olduğu müeyyen olunmuşdur. Meselen HIV-2 HIV-1e göre seksual ve vertikal gönder daha az bulaşma müşahide edilmekdedir.Bundan başqa HIV-1 ve HIV-2 serolojik ve molekulyar quruluş olaraq daha asanlıqla ayrıla bilmekdedir. HIV-1 ve HIV-2in genomunda iki ehemiyyetli ferqlilikdir. HIV-1 de olan ‘vpu geni’ HIV-2 de yoxdur. Ayrıca HIV-2 de elaveden HIV-1 de olmayan ‘vpx geni’ var.